员工辞职当月，公司负责缴纳的社保部分，是否违法？

大部分都是违法的。1、有下列情形之一的用人单位可以代扣劳动者工资:(一)用人单位代扣代缴的个人所得税:(2)用人单位代扣代缴的各种社会保险费用由劳动者个人承担;(3)法院判决、裁定中要求扣除的抚养费、赡养费(4)法律法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。2、因劳动者自身原因给用人单位造成经济损失的用人单位可以按照劳动合同要求赔偿经济损失。经济损失的赔偿可以从工人本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。如果扣除剩余工资低干当地目最低工资标准的按最低工资标准支付。
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实际中，被单位扣工资，如果是劳动者因自身问题耽误工作，适当扣除部分工资是合法的，当然，不同公司会有不同的规定。
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公司应支付部分就算在离职的当月结束，及员工的社保公司就承办到离职的当月。之后，员工离职次月而公司停止为其缴交社保费用。如果员工应缴纳的部分已经被扣除了，那单位的部分还是得单位交。不能从员工的工资里扣单位应交部分。法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第五十八条用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。